Protein–RNA interactions for Protein: Q99KC8

Vwa5a, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5aQ99KC8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vwa5aQ99KC8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vwa5aQ99KC8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vwa5aQ99KC8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms