Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pls3Q99K51 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pls3Q99K51 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pls3Q99K51 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms