Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lims1Q99JW4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lims1Q99JW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms