Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GatbQ99JT1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GatbQ99JT1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms