Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tspan1Q99J59 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tspan1Q99J59 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tspan1Q99J59 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms