Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Slc8b1Q925Q3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Slc8b1Q925Q3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slc8b1Q925Q3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms