Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PdgfdQ925I7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PdgfdQ925I7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms