Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Lmo1Q924W9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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Lmo1Q924W9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Lmo1Q924W9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lmo1Q924W9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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