Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nrif1Q923B3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nrif1Q923B3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nrif1Q923B3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms