Protein–RNA interactions for Protein: Q921N6

Ddx27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx27Q921N6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx27Q921N6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx27Q921N6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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