Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q4

Vps16, Vacuolar protein sorting-associated protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps16Q920Q4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps16Q920Q4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps16Q920Q4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps16Q920Q4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms