Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms