Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Smarca5Q91ZW3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smarca5Q91ZW3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms