Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y07

Pcdhb12, MCG141300, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb12Q91Y07 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb12Q91Y07 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcdhb12Q91Y07 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcdhb12Q91Y07 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms