Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zkscan3Q91VW9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Zkscan3Q91VW9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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