Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hps3Q91VB4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hps3Q91VB4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hps3Q91VB4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms