Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SfpqQ8VIJ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SfpqQ8VIJ6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms