Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc71Q8VEG0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc71Q8VEG0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc71Q8VEG0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms