Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Cul7Q8VE73 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Cul7Q8VE73 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Cul7Q8VE73 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms