Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE47

Uba5, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 5, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba5Q8VE47 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Uba5Q8VE47 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Uba5Q8VE47 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Uba5Q8VE47 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms