Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDM4

Psmd2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd2Q8VDM4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psmd2Q8VDM4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psmd2Q8VDM4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd2Q8VDM4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms