Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Alg12Q8VDB2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Alg12Q8VDB2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Alg12Q8VDB2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Alg12Q8VDB2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Alg12Q8VDB2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms