Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sgip1Q8VD37 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sgip1Q8VD37 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sgip1Q8VD37 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms