Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt25Q8VCW2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt25Q8VCW2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt25Q8VCW2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms