Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rapgef3Q8VCC8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rapgef3Q8VCC8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rapgef3Q8VCC8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
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