Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc9Q8VC31 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ccdc9Q8VC31 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc9Q8VC31 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms