Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BbxQ8VBW5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BbxQ8VBW5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms