Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc58Q8R3Q6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms