Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim29Q8R2Q0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257.3 ms