Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K4

Taf6l, TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6lQ8R2K4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Taf6lQ8R2K4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Taf6lQ8R2K4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Taf6lQ8R2K4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf6lQ8R2K4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf6lQ8R2K4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Taf6lQ8R2K4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms