Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg10Q8R1P4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg10Q8R1P4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg10Q8R1P4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms