Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sf3b4Q8QZY9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sf3b4Q8QZY9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sf3b4Q8QZY9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms