Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Foxn4Q8K3Q3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Foxn4Q8K3Q3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Foxn4Q8K3Q3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms