Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rdh16f2Q8K3M1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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