Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdk5rap2Q8K389 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdk5rap2Q8K389 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdk5rap2Q8K389 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdk5rap2Q8K389 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms