Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ssh3Q8K330 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms