Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SrrdQ8K2M3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SrrdQ8K2M3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SrrdQ8K2M3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms