Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Abcf3Q8K268 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Abcf3Q8K268 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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