Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0T0

Rtn1, Reticulon-1, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn1Q8K0T0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rtn1Q8K0T0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtn1Q8K0T0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms