Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rasgef1bQ8JZL7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rasgef1bQ8JZL7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rasgef1bQ8JZL7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms