Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Znf628Q8CJ78 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms