Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tshz3Q8CGV9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tshz3Q8CGV9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tshz3Q8CGV9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms