Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brf1Q8CFK2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Brf1Q8CFK2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Brf1Q8CFK2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms