Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkl1Q8CEQ0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms