Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD33

6030452D12Rik, RIKEN cDNA 6030452D12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030452D12RikQ8CD33 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6030452D12RikQ8CD33 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
6030452D12RikQ8CD33 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms