Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ufl1Q8CCJ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ufl1Q8CCJ3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms