Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Slfn5Q8CBA2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Slfn5Q8CBA2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slfn5Q8CBA2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 304.7 ms