Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fbxo48Q8CAT8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Fbxo48Q8CAT8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Fbxo48Q8CAT8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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