Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Podxl2Q8CAE9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Podxl2Q8CAE9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Podxl2Q8CAE9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms