Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q8C708 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q8C708 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C708 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C708 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C708 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C708 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C708 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C708 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C708 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C708 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q8C708 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q8C708 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q8C708 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C708 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C708 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C708 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C708 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C708 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q8C708 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q8C708 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8C708 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8C708 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8C708 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8C708 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8C708 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8C708 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8C708 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8C708 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q8C708 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8C708 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8C708 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C708 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C708 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C708 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C708 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C708 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C708 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8C708 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms